Module 3 Visualisation II

Objectifs

  • Savoir réaliser différentes variantes de graphiques visant à montrer comment les données se distribuent tel que les histogrammes, les graphes de densité ou encore les diagrammes en violon dans R avec la fonction chart()

  • Intégrer ensuite des graphiques dans un rapport et y décrire ce que vous observez

  • Gérer des conflits dans GitHub

Prérequis

Pour réaliser les exercices dans ce module, vous devez être capables de travailler dans la SciViews Box et dans RStudio. Vous devez également maîtriser les bases de Git et GitHub. Tout ceci est enseigné dans le module 1. Vous devez également être familiarisés avec les graphiques dans R et R Markdown, une matière qui fait l’objet du module 2.

Préparatifs

Une nouvelle tâche vous est demandée ci-dessous en utilisant GitHub Classroom 1.2.4.3. Une fois votre assignation réalisée, faites un clone de votre dépôt et placez-le dans le dossier shared/projects. Pour cette tâche, vous démarrerez d’un projet RStudio B.1.1 que vous obtiendrez via une tâche GitHub Classroom.

Pour cette activité, vous allez travailler en binôme sur les données d’un projet étudiant le zooplancton provenant de Madagascar.

Les explications relatives à la tâche qui vous est assignée sont dans le fichier README.mddu dépôt accessible depuis :

  • Pour l’année académique 2019-2020, les URLs à utiliser pour accéder à votre tâche sont les suivants :

  • Pour les autres utilisateurs de ce livre, veuillez faire un “fork” du dépôt sdd1_zooplankton. Si vous souhaitez accéder à une version précédente de l’exercice, sélectionner la branche correspondante à l’année que vous recherchez.

Vous utiliserez à la fois votre projet sur la biométrie des oursins (du module précédent) et ce nouveau projet sur le zooplancton5 pour découvrir les nouveaux outils graphiques décrits dans ce module.

  1. Le mot zooplancton ne se décline jamais au pluriel. On parle du zooplancton pour désigner une large communauté d’organismes zooplanctoniques, et non pas des zooplanctons.↩