Module 4 Séries chronologiques I

Objectifs

• Comprendre ce qu’est une série chronologique (ou spatio-temporelle)

• Manipuler les séries chronologiques dans R, les décrire et en faire des représentations graphiques appropriées

• Maîtriser la notion d’autocorrélation, la fonction d’autocorrélation et son interprétation

• Pouvoir détecter des tendances locales, globales et des cycles dans les séries

Prérequis

Ce module nécessite d’être à l’aise avec R, RStudio et R Markdown. Les six premiers modules du cours 1 (en particulier, la visualisation et le traitement des données) doivent être acquis. La notion de corrélation (module 12 du cours 1) doit également être bien comprise au départ.

Nous utiliserons ici essentiellement le package R {pastecs} qui est une réécriture entre autres par l’un des auteurs de ce cours du logiciel PASSTEC 2000, un programme écrit en Visual Basic par le Prof. Frédéric Ibañez dans les années 1980, sous la direction de ce dernier. C’est au Prof. Ibañez que l’on doit d’avoir rassemblé un grand nombre de techniques utiles en écologie et en biologie en général en matière d’analyse de séries spatio-temporelles, et d’en avoir démontré l’utilité quelque fois pour la première fois.