Module 7 Données particulières

Le cours SDD IV, comme son nom l’indique, est essentiellement axé vers le développement de pratiques qui rendront vos analyses reproductibles. Cela signifie que quelqu’un d’autre pourra reprendre vos analyses et générer exactement les mêmes résultats, tableaux et graphiques.

Nous abordons plusieurs modules supplémentaires par rapport à la matière des 3 premiers cours.

  • Le premier module (celui-ci) s’intéresse aux données particulières : dates, données textuelles, données circulaires que vous rencontrerez certainement durant votre carrière de biologiste.

  • Le second module du cours (module 8) vous préparera à l’élaboration d’un gros projet scientifique qui diffère des projets que vous avez traités jusqu’ici par le nombre d’étapes et de fichiers plus importants.

  • Le module 9 s’intéressera à la modularisation de votre code pour le rendre plus compréhensible et maintenable.

  • Le module 10 s’attaquera aux questions d’optimisation et de test de vos analyses et de votre code.

  • Le module 11 rentrera plus en profondeur dans l’accès aux bases de données.

  • Enfin, le module 12 vous proposera de placer l’ensemble de vos fichiers relatifs à une analyse dans un package R pour en faciliter la diffusion.

Objectifs
  • Gérer des données autres que numériques et facteurs

  • Convertir et utiliser des dates et diverses mesures du temps en général

  • Manipuler des informations textuelles, y compris à l’aide d’expressions régulières

  • Comprendre, visualiser et analyser des données circulaires

Prérequis

Avant de vous lancer dans ce cours, vous devez installer et vous familiariser avec la SciViews Box 2022. Si ce n’est pas encore fait, retournez à la page d’accueil pour bien débuter.

L’utilisation d’un ordinateur, de RStudio et de (R) Markdown ne doit plus avoir de secret pour vous ou presque.

À vous de jouer !
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Vous devez aussi maîtriser les bases de Git et de GitHub (avoir un compte GitHub, savoir cloner un dépôt localement, travailler avec GitHub Desktop pour faire ses “commits”, “push” et “pull”).

À vous de jouer !
h5p

L’ensemble de ces outils a été abordé dans les cours précédents SDD I, SDD II et SDD III (les six premiers modules du présent cours) que vous devez avoir réalisé avant d’entamer la matière du cours SDD IV : pratique.