Module 1 Régression linéaire I

Objectifs
  • Retrouver ses marques avec R, RStudio et la SciViews Box et découvrir les fonctions supplémentaires de la nouvelle version.

  • Découvrir la régression linaire de manière intuitive.

  • Découvrir les outils de diagnostic de la régression linéaire, en particulier l’analyse des résidus.

Prérequis

Avant de nous lancer tête baissée dans de la matière nouvelle, nous allons installer la dernière version de la SciViews Box. Une nouvelle version est disponible chaque année début septembre. Reportez-vous à l’appendice A pour son installation et pour la migration éventuelle de vos projets depuis la version précédente. Une fois la box installée, consacrez un petit quart d’heure à repérer les icônes nouvelles dans le Dock et dans le menu Applications. Vous retrouverez R et RStudio, mais dans des version plus récentes qui apportent également leur lot de nouveautés. Lancez RStudio et repérez ici aussi les nouveaux onglets et les nouvelles entrées de menu. Aidez-vous de l’aide en ligne ou de recherches sur le net pour vous familiariser avec ces nouvelles fonctionnalités.

Une fois la nouvelle SciViews Box fonctionnelle sur votre ordinateur, vous allez réaliser une séance d’exercice couvrant les points essentiels des notions abordées dans le livre science des données biologiques partie 1, histoire de rafraîchir vos connaissances. Les tutoriaux learnr auxquels vous êtes maintenant habitués seront là pour vous aider à auto-évaluer votre progression. Pour le cours 2, ces tutoriaux sont dans le package BioDataScience2 que vous venez normalement d’installer si vous avez bien suivi toutes les instructions de configuration de votre SciViews Box (sinon, vérifiez votre configuration).

Démarrez la SciViews Box et RStudio. Dans la fenêtre Console de RStudio, entrez l’instruction suivante suivie de la touche Entrée pour ouvrir le tutoriel concernant les bases de R :

BioDataScience2::run("01a_rappel")
N’oubliez pas d’appuyer sur la touche ESC pour reprendre la main dans R à la fin d’un tutoriel dans la console R.