Module 5 Classification hiérarchique

Objectifs

• Comprendre la notion de distance et la matrice de distance.

• Appréhender la classification hiérarchique et le dendrogramme.

• Être capable d’effectuer un regroupement pertinent des individus d’un jeu de données multivarié à l’aide de ces techniques.

Prérequis

Vous devez être à l’aise avec l’utilisation de R et Rstudio, en particulier pour l’importation, le remaniement et la visualisation de données multivariées. Ceci correspond au cours SDD I. Il n’est pas nécessaire d’avoir acquis toutes les notions vue dans la partie Cours II :modélisation pour pouvoir comprendre cette seconde partie du cours. Si vous ne vous sentez pas assez à l’aise avec R et RStudio, c’est peut-être le bon moment pour refaire le premier “learnr” du package BioDataScience2 :

Démarrez la SciViews Box et RStudio. Dans la fenêtre Console de RStudio, entrez l’instruction suivante suivie de la touche Entrée pour ouvrir le tutoriel concernant les bases de R :

BioDataScience2::run("01a_rappel")

N’oubliez pas d’appuyer sur la touche ESC pour reprendre la main dans R à la fin d’un tutoriel dans la console R.