Science des données biologiques II
2024-12-05
Préambule
Patientez s’il-vous-plait, diagnostic en cours…
Cet ouvrage est conçu pour être utilisé de manière interactive en ligne. En effet, vous y trouverez des vidéos, des démonstrations interactives, et des exercices sous forme de questionnaires interactifs. Ces différents éléments ne sont, bien évidemment, utilisables qu’en ligne.
Le matériel dans cet ouvrage est distribué sous licence CC BY-NC-SA 4.0.
Raphaël Conotte a contribué à des versions antérieures (il n’est plus listé comme co-auteur de cet ouvrage, car ses contributions ont disparu au fil des remaniements successifs).
Informations système
# ─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
# setting value
# version R version 4.3.3 (2024-02-29)
# os macOS Sonoma 14.6.1
# system aarch64, darwin20
# ui X11
# language (EN)
# collate en_US.UTF-8
# ctype en_US.UTF-8
# tz Europe/Brussels
# date 2024-12-05
# pandoc 3.2 @ /Applications/RStudio.app/Contents/Resources/app/quarto/bin/tools/aarch64/ (via rmarkdown)
#
# ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
# package * version date (UTC) lib source
# anytime 0.3.9 2020-08-27 [1] RSPM (R 4.3.0)
# assertthat 0.2.1 2019-03-21 [1] RSPM (R 4.3.0)
# base64enc 0.1-3 2015-07-28 [1] RSPM (R 4.3.0)
# bit 4.0.5 2022-11-15 [1] RSPM (R 4.3.0)
# bit64 4.0.5 2020-08-30 [1] RSPM (R 4.3.0)
# bookdown 0.39 2024-04-15 [1] RSPM (R 4.3.0)
# bslib 0.7.0 2024-03-29 [1] RSPM (R 4.3.0)
# cachem 1.0.8 2023-05-01 [1] RSPM (R 4.3.0)
# cli 3.6.2 2023-12-11 [1] RSPM (R 4.3.0)
# data.table 1.15.4 2024-03-30 [1] RSPM (R 4.3.0)
# digest 0.6.35 2024-03-11 [1] RSPM (R 4.3.0)
# evaluate 0.23 2023-11-01 [1] RSPM (R 4.3.0)
# fastmap 1.1.1 2023-02-24 [1] RSPM (R 4.3.0)
# getPass 0.2-4 2023-12-10 [1] RSPM (R 4.3.0)
# glue 1.7.0 2024-01-09 [1] RSPM (R 4.3.0)
# htmltools 0.5.8.1 2024-04-04 [1] RSPM (R 4.3.0)
# htmlwidgets 1.6.4 2023-12-06 [1] RSPM (R 4.3.0)
# httpuv 1.6.15 2024-03-26 [1] RSPM (R 4.3.0)
# httr 1.4.7 2023-08-15 [1] RSPM (R 4.3.0)
# jquerylib 0.1.4 2021-04-26 [1] RSPM (R 4.3.0)
# jsonlite 1.8.8 2023-12-04 [1] RSPM (R 4.3.0)
# keyring 1.3.2 2023-12-11 [1] RSPM (R 4.3.0)
# knitr 1.46 2024-04-06 [1] RSPM (R 4.3.0)
# later 1.3.2 2023-12-06 [1] RSPM (R 4.3.0)
# lattice 0.22-6 2024-03-20 [1] RSPM (R 4.3.0)
# learnitdown 1.8.0 2024-09-15 [1] Github (learnitr/learnitdown@90320c2)
# learnr 0.11.5 2023-09-28 [1] RSPM (R 4.3.0)
# lifecycle 1.0.4 2023-11-07 [1] RSPM (R 4.3.0)
# magick 2.8.3 2024-02-18 [1] RSPM (R 4.3.0)
# magrittr 2.0.3 2022-03-30 [1] RSPM (R 4.3.0)
# mime 0.12 2021-09-28 [1] RSPM (R 4.3.0)
# mongolite 2.7.3 2023-12-04 [1] RSPM (R 4.3.0)
# nanotime 0.3.7 2022-10-24 [1] RSPM (R 4.3.0)
# PKI 0.1-12 2022-11-28 [1] RSPM (R 4.3.0)
# promises 1.3.0 2024-04-05 [1] RSPM (R 4.3.0)
# R6 2.5.1 2021-08-19 [1] RSPM (R 4.3.0)
# Rcpp 1.0.12 2024-01-09 [1] RSPM (R 4.3.0)
# RcppCCTZ 0.2.12 2022-11-06 [1] RSPM (R 4.3.0)
# remotes 2.5.0 2024-03-17 [1] RSPM (R 4.3.0)
# rlang 1.1.3 2024-01-10 [1] RSPM (R 4.3.0)
# rmarkdown 2.26 2024-03-05 [1] RSPM (R 4.3.0)
# rprojroot 2.0.4 2023-11-05 [1] RSPM (R 4.3.0)
# rstudioapi 0.16.0 2024-03-24 [1] RSPM (R 4.3.0)
# sass 0.4.9 2024-03-15 [1] RSPM (R 4.3.0)
# sessioninfo 1.2.2 2021-12-06 [1] RSPM (R 4.3.0)
# shiny 1.8.1.1 2024-04-02 [1] RSPM (R 4.3.0)
# shinylogs 0.2.1 2022-04-18 [1] RSPM (R 4.3.0)
# shinytoastr 2.2.0 2023-08-30 [1] RSPM (R 4.3.0)
# webshot 0.5.5 2023-06-26 [1] RSPM (R 4.3.0)
# withr 3.0.0 2024-01-16 [1] RSPM (R 4.3.0)
# xfun 0.43 2024-03-25 [1] RSPM (R 4.3.0)
# xtable 1.8-4 2019-04-21 [1] RSPM (R 4.3.0)
# yaml 2.3.8 2023-12-11 [1] RSPM (R 4.3.0)
# zoo 1.8-12 2023-04-13 [1] RSPM (R 4.3.0)
#
# [1] /Users/phgrosjean/Library/R/arm64/4.3/library
# [2] /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.3-arm64/Resources/library
#
# ──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────